被人诬告强奸罪的处理方式为：首先聘请律师搜集证据证明自身无罪，国家侦查机关同时也会对案件进行调查，待最终被宣判无罪后，可以控告对方诬告陷害，并向其提出民事赔偿。
《中华人民共和国刑法》第二百四十三条 捏造事实诬告陷害他人，意图使他人受刑事追究，情节严重的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制；造成严重后果的，处三年以上十年以下有期徒刑。国家机关工作人员犯前款罪的，从重处罚。不是有意诬陷，而是错告，或者检举失实的，不适用前两款的规定。